Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Necab1Q8BG18 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms