Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn34b3Q80ZS5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34b3Q80ZS5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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