Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Amigo1Q80ZD8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Amigo1Q80ZD8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Amigo1Q80ZD8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Amigo1Q80ZD8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Amigo1Q80ZD8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms