Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Negr1Q80Z24 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms