Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrfn4Q80XU8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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