Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg2bQ80XK6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2bQ80XK6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms