Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnupnQ80W37 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SnupnQ80W37 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnupnQ80W37 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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