Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vgll4Q80V24 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll4Q80V24 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll4Q80V24 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll4Q80V24 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll4Q80V24 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms