Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lamp3Q7TST5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lamp3Q7TST5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms