Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ClmQ7TSN2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClmQ7TSN2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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