Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnf1Q7TSH7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnf1Q7TSH7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms