Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf516Q7TSH3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf516Q7TSH3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf516Q7TSH3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf516Q7TSH3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf516Q7TSH3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf516Q7TSH3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf516Q7TSH3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf516Q7TSH3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf516Q7TSH3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf516Q7TSH3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf516Q7TSH3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf516Q7TSH3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms