Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PhkbQ7TSH2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PhkbQ7TSH2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms