Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg1cQ7TSF0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms