Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Clec4b1Q7TS58 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Clec4b1Q7TS58 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms