Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf18Q7TS55 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms