Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shq1Q7TMX5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shq1Q7TMX5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms