Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg4Q7TMD7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms