Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TwistnbQ78WZ7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwistnbQ78WZ7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms