Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Igsf3Q6ZQA6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms