Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc44a1Q6X893 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc44a1Q6X893 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms