Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pcp4l1Q6W8Q3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pcp4l1Q6W8Q3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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