Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tfap2eQ6VUP9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tfap2eQ6VUP9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tfap2eQ6VUP9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tfap2eQ6VUP9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tfap2eQ6VUP9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tfap2eQ6VUP9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tfap2eQ6VUP9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tfap2eQ6VUP9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tfap2eQ6VUP9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tfap2eQ6VUP9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tfap2eQ6VUP9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tfap2eQ6VUP9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms