Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms