Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms