Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms