Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms