Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6PD19 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6PD19 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6PD19 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6PD19 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6PD19 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6PD19 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6PD19 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6PD19 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6PD19 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6PD19 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6PD19 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q6PD19 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q6PD19 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q6PD19 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q6PD19 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q6PD19 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms