Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RgmaQ6PCX7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RgmaQ6PCX7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms