Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhb9Q6PB60 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhb9Q6PB60 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms