Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cyp2d40Q6P8N9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp2d40Q6P8N9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms