Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smchd1Q6P5D8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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