Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Asic1Q6NXK8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms