Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HelbQ6NVF4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms