Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo41Q6NS60 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo41Q6NS60 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms