Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hecw2Q6I6G8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hecw2Q6I6G8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms