Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smarca2Q6DIC0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Smarca2Q6DIC0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms