Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms