Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brsk2Q69Z98 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brsk2Q69Z98 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms