Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Arhgef39Q66JY6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Arhgef39Q66JY6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arhgef39Q66JY6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms