Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ino80dQ66JY2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ino80dQ66JY2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms