Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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PtprdQ64487 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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PtprdQ64487 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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PtprdQ64487 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PtprdQ64487 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtprdQ64487 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprdQ64487 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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