Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Irf4Q64287 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf4Q64287 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms