Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pan3Q640Q5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pan3Q640Q5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms