Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc18Q640L5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
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