Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PatjQ63ZW7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms