Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col4a5Q63ZW6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a5Q63ZW6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms