Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms