Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic2Q62520 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms