Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vat1Q62465 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms